La educación Secundaria es el complemento de la educación básica en este nivel existen varias modalidades, entre ellas se encuentran: Las secundaria generales, las técnicas, (Industriales, Pesqueras y forestales), las secundarias para trabajadores y las telesecundarias.

Secundaria General

Se encuentra en áreas urbanas y rurales. Cuenta con talleres y laboratorios y atiende alumnos de 13 a 15 años de edad; cada asignatura es impartida por un profesor especializado en el tema.

Secundaria Técnica

Proporciona estudios generales a alumnas y alumnos de 13 a 15 años de edad y cada asignatura es impartida por un profesor especializado. Se hace énfasis en la educación tecnológica, la cual se establece de acuerdo con la actividad económica de cada región, ya sea agropecuaria, pesquera, forestal o de servicios, tanto en comunidades rurales como urbanas.

Telesecundaria

Atiende a alumnos de 13 a 15 años y está diseñada para funcionar preferentemente en comunidades rurales que tienen menos de 2500 habitantes y en las que no es posible instalar escuelas secundarias generales o técnicas por que hay un número reducido de egresados de primaria.
Las características de los servicios educativos de la telesecundaria son: Combina elementos de la modalidad escolarizada con aspectos específicos de la educación a distancia.
Hay un solo maestro, que es responsable de enseñanza- aprendizaje Utiliza medios electrónicos y material impreso.

Titular: Profr. Sigifredo Evodio García Martínez Cargo: Jefe de Departamento Departamento de Escuelas Secundarias Generales Oficinas centrales del IEEPO, Carret. Cristóbal Colón Km. 5.5, Ixcotel, Oaxaca, Oax., C.P. 68100 Tels. [951] 515-3900 y 513-8745 ext. 286 y 287

Titular: Prof. José Luis Herrera Peralta Cargo: Jefe de Departamento Departamento de Escuelas Secundarias Técnicas Oficinas centrales del IEEPO, Carret. Cristóbal Colón Km. 5.5, Ixcotel, Oaxaca, Oax., C.P. 68100 Tels. [951] 513-6599, 515-3900 ext. 404 y 405

Titular: Profr. Juan Vásquez León Cargo: Jefe de Departamento Departamento de Escuelas Telesecundarias Oficinas centrales del IEEPO, Carret. Cristóbal Colón Km. 5.5, Ixcotel, Oaxaca, Oax., C.P. 68100 Tel. [951] 515-3900 ext.280, 282 y 289